原因：导航SDK的内部使用的也是地图的SDK来实现的，导航SDK中默认会使用地图的导航模式，这也是一种自定义样式，用户设置过地图的自定义样式以后，进入导航会被导航再次重置为导航模式，所以导致设置的自定义样式无效。

解决方法如下：

1、使用AMapNaviViewOptions的setCustomMapStylePath方法，把自定义样式文件的路径传入。

2、通过AMapNaviView的setViewOptions方法把option设置进来即可。这样导航内部就会使用您设置的自定义样式文件了。

需要注意：如果您通过setNaviNight设置了黑夜模式，这个时候您的自定义样式也是会失效的。